サントリーホールの設計にあたっては「世界一美しい響き」を基本コンセプトに掲げ、第一線で活躍する指揮者や演奏家はもとより音楽を愛する各界の人々の意見が幅広く取りいれられました。大ホールは、日本では初のヴィンヤード（ぶどう畑）形式。全2006席がぶどうの段々畑状にステージ（太陽）を向いているため、音楽の響きは太陽の光のようにすべての席に降り注ぎます。音響的にも視覚的にも演奏者と聴衆が一体となって互いに臨場感あふれる音楽体験を共有することができる形式です。側壁を三角錐とし、天井は内側に湾曲させ、客席のすみずみに理想的な反射音を伝える構造です。客席はブロック分けされていますが、その側壁も反射壁として有効に活用されています。壁面の内装材にはウイスキーの貯蔵樽に使われるホワイトオーク材を、そして、床や客席の椅子背板にはオーク（楢）材をと、ふんだんに木を使用し、暖かみのある響きを実現。音響的な効果とともに、視覚的にも落ち着いた雰囲気を醸し出しています。

大ホール正面に位置するオルガンは、ストップ数*74、パイプ総数5,898本を有し、世界でも最大級です。オーストリアの名門リーガー社のマイスターが、ホールの音響特性にふさわしい柔かく暖かみのある響きを求めて、1本1本のパイプ、1つ1つのリードに至るまで手作りで製作し、ホールに据えつけてからも微調整を重ね、完璧な整音を施しました。
このオルガンは、ストップ数が多く、コンサートホールのオルガンとして幅広いレパートリーに対応できます。

* ストップ数：音色を使い分ける機構の数

演奏は、オルガンに組み込まれたメインコンソール（演奏台）の他、ステージの上からリモートコンソールを用いて行うこともできます。
左側がメインコンソール。4段の手鍵盤と足鍵盤を備えています。手鍵盤の左右にある丸いノブがストップです。オルガンの音楽には、オーケストラなど舞台と一緒に演奏するものもあります。そんな時、オルガニストは舞台に背を向けているのでモニター画面で指揮者を映しています。
右側は、リモートコンソール。これを演奏すると電気信号がオルガンに流れ、写真奥のオルガンから音が出ます。